I valget af rørledningsvarmemedium, som er det, vi kalder vand, er det bedst at bruge rent vand, hvis det er muligt. Fordi der ikke er mineraler som calcium- og magnesiumioner i det rene vand, vil der ikke være nogen afskalning eller tilstopning af rør. Derudover vil der ikke blive produceret svampe. Hvis der er svampe i vandet, vil der i lang tid vokse nogle klistrede ting i rørene, hvilket vil påvirke vandets strømningshastighed. Hvis det ikke er muligt at bruge rent vand, anbefales det at tilsætte siliciumfosforkrystaller, når systemet først fyldes med vand efter at rørledningen er skyllet. Når vandet injiceres, lad vandet strømme gennem silicium-fosforkrystaltanken, som også kan spille rollen som afkalkning, forhindrer rørledningsskalering og sterilisering og kan holde rørledningen holdbar, og effekten vil ikke være særlig stor reduceret med tiden. I mange områder i nord bruger alle almindeligt postevand, når de skal fylde vand op. Vandkvaliteten er forholdsvis hård, og der er mange mineraler i den. Efter lang tid i rørledningen er det let at kalke og danne vand og alkali, og der vil være en masse rodet i røret. Det er netop derfor, at der er opstået en ny branche, som er specialiseret i gulvvarmerørsrensning. Derudover vil der, efter at gulvvarmeprojektet er afsluttet, være en masse tætningsmaterialer som hamp og PTFE-råmaterialetape i hovedrørledningen. Disse materialer vil falde af under brug, for eksempel ved skruning af gevindforbindelser. i pipelinen. En erfaren forhandler vil installere en Y-si på gulvvarmemanifolden. Når gulvvarmeprojektet er afsluttet, skal rørledningen skylles med højt tryk, alt dette snavs kan skylles ud, og mange ting kan skylles ud. Det anbefales at rense filteret én gang efter skylning. Dette kan sikre, at der ikke er blokering i hovedrøret og vil ikke påvirke varmeeffekten.
